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供参考：1.1SARS冠状病毒M蛋白氨基酸序列从GenBank目前已公布的19个SARS冠状病毒的基因组中确定M蛋白氨基酸序列，以PubMed提供的Blast进行多重比对，分析其氨基酸变异情况，确定氨基酸序列。1.2SARS冠状病毒M蛋白的跨膜区预测采用SOSUI服务器[9]（http://SOSUI.proteome.bio.tuat.ac.jp/sosuiframe0.html），将氨基酸序列输入工作区预测跨膜区。1.3SARS冠状病毒M蛋白二级结构预测用SOPMA服务器[10]（http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html）预测SARS冠状病毒M蛋白的二级结构。1.4SARS冠状病毒M蛋白亲水性、可及性、极性及柔韧性参数预测采用Hopp&Woods亲水性参数[11]、Janin可及性参数[12]、Zimmerman极性参数[13]及柔韧性参数预测（http://www.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl）。1.5EMBOSS服务器对SARS冠状病毒M蛋白抗原位点的预测采用EMBOSS服务器（http://www.mifoundation.org/Tools/）预测其抗原位点[14]。1.6综合分析将上述方法互相参照，综合分析比较，兼顾各预测参数推断SARS冠状病毒M蛋白B细胞识别的表位，并用吴玉章等[15]建立的抗原性指数（AI）对预测的M蛋白B细胞表位进行综合评判。

knewman 2005-07-20

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